Eine Krypte (von gr. κρυπτός „verborgen, versteckt“) bezeichnet als medizinischer Fachbegriff eine epithelialisierte Vertiefung der Schleimhaut, welche bis in tiefere Wandschichten hineinreicht. Anatomische Beispiele sind:
- Cryptae tonsillares der Gaumen- und Zungenmandel
- Cryptae intestinales (Lieberkühn-Krypten) des Dünn- und Dickdarms
- Cryptae anales des Analkanals
- Rokitansky-Aschoff-Krypten der Gallenblase
- Glandulae cervicales uteri des Gebärmutterhalses
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